مقایسه توالی ژن dbat، در سطح نوکلئوتیدی و آمینواسیدی، در گونه‮های سرخدار و قارچ های اندوفیت

هدف: هدف از این تحقیق، بررسی حضور ژن dbat، یکی از ژن های کلیدی در مسیر بیوسنتزی تاکسول، در سرخدار (taxus baccata) و قارچ اندوفیت مولد تاکسول آن و نیز بررسی میزان شباهت این توالی ها با توالی های موجود در بانک ژن بود. مواد و روش ها: در این تحقیق، قارچ های اندوفیت از پوست درخت سرخدار جداسازی و به روش نوک هیف خالص سازی شدند. dna ژنومی درخت سرخدار و یکی از قارچ های مولد تاکسول (ایزوله t9) استخراج گردید. حضور ژن dbat به‏وسیله واکنش زنجیره‏ای پلیمراز بررسی گردید. پس از توالی یابی، میزان شباهت توالی های به‏دست آمده از سرخدار و ایزوله t9 با توالی های سایر گونه های سرخدار و قارچ‏های اندوفیت، موجود در پایگاه بانک ژن، مقایسه شدند. نتایج: با استفاده از پرایمرهای اختصاصی، یک قطعه bp 125 از ژن dbat سرخدار و ایزوله t9 تکثیر گردید. هم‏ردیفی توالی نوکلئوتیدی و آمینواسیدی قارچ و گیاه میزبان نشان داد که این توالی ها دارای شباهت بسیار بالایی (بیش از 98درصد) بودند. نتایج هم‏ردیفی این توالی ها با توالی های گونه های دیگر سرخدار و قارچ های اندوفیت، نیز شباهت بسیار بالایی (98 تا100 درصد) را نشان داد. همچنین، شباهت نسبتا بالایی در توالی نوکلئوتیدی و آمینواسیدی آنزیم dbat و سایر آنزیم‏های آسیل و آروئیل ترانسفراز درگیر در مسیر بیوسنتزی تاکسول مشاهده شد. نتیجه گیری: براساس نتایج، حضور ژن dbat در قارچ اندوفیت مولد تاکسول جداشده از سرخدار و همچنین شباهت بسیار بالا آن، در سطح نوکلئوتیدی و آمینواسیدی، با توالی بدست آمده از ژن dbat میزبان (taxus baccata) و توالی گونه های دیگر سرخدار و نیز قارچ های اندوفیت به اثبات رسید